在种子外层有外果皮、果肉、果胶、内果皮与银皮等构造，而加工处理的目的就是为了去除这些外部的构造，以取得内部的咖啡种子。
一，水洗法
1，工艺程序
①将咖啡果倒入水槽中，发育不全及劣质的咖啡果会漂浮在水面上，而成熟饱满的咖啡果会沉在水底，通过这种方式达到筛选咖啡果的目的，去除浮豆，清洁咖啡果。
②将咖啡果通过果肉筛除机，去除咖啡果实中的外表皮及果肉，留下带内果胶、内果皮、银皮的咖啡豆。
③将带着果胶的咖啡豆倒入发酵池发酵，发酵16-36小时将果胶溶解，再次清洗咖啡豆，清除杂质及发酵残留物。
④将咖啡豆倒入机器烘干或者直接晒干，将咖啡豆水分降至10%-16%，再倒入脱壳机将咖啡豆表面的内果皮与银皮去除，得到干净的咖啡豆。
2，水洗法特点：
①能够筛除大部分不成熟及品质差的果实，能保证咖啡豆的整体品质，外观较为完整美观。
②程序相对复杂，需要耗费大量水资源，成本较高。
3，水洗法咖啡豆特点
咖啡风味明亮，带酸味及果香。
二，日晒法
1，工艺程序
①同水洗法第一步，用水清洗咖啡豆及去除发育不良及劣质的咖啡果。
②将咖啡果均匀平铺接受阳光曝晒，并每天定时翻动保证曝晒均匀，待咖啡豆中水分降低到10%-16%，则曝晒完成。
③将咖啡果倒入脱壳机，脱去咖啡豆外壳，得到干净的咖啡豆。
2，日晒法特点
①工艺程序简单，成本低廉。
②过程不容易掌控，例如日晒不足、晒过头、发霉等情况
3，日晒法咖啡豆特点
咖啡醇香浓厚，带有甜味。
三，蜜处理
1，工艺程序
①同水洗与日晒法第一步，用水清洗咖啡豆及去除发育不良及劣质的咖啡果。
②同水洗法第二步，去除咖啡果实中的外表皮及果肉，留下带内果胶、内果皮、银皮的咖啡豆。
③不同于水洗法将带果胶的咖啡豆直接发酵，蜜处理法同日晒法将带着果胶的咖啡豆放在太阳下曝晒，待咖啡豆水含量降低至10%-16%。
④将晒干的咖啡豆倒入脱壳机将咖啡豆表面的内果皮与银皮去除，得到干净的咖啡豆。
2，蜜处理法特点
①去除果肉，避免发霉。
②工艺程序最复杂。
3，蜜处理法咖啡豆特点
风味香醇，酸度与甜度较为平衡。
